農產品供應鏈管理是當今國內外研究的熱點之一，農產品供應鏈管理是其中的一個重要的研究方向，并成為農產品生產、加工、交易和流通企業有力的競爭工具之一。隨著農產品貿易自由化、全球化進程的加快，農產品從最初的生產到最終用戶的管理行為日趨復雜，對農產品安全與質量的要求日益嚴格。

在這種形勢下，農產品的生產經營單位應從組織生產、滿足日益變化的個性化需求、降低物流運作成本、嚴格農產品安全與質量出發，由農產品生產者到消費者組成的供應鏈管理來協調解決這些問題。

1、對農產品供應鏈管理的市場導向觀念認識不足，難以形成計劃、生產、運輸、交易銷售、服務和監管為一體的食用農產品供應鏈。大部分農戶、經銷商一盤散沙，農戶生產或養殖的產品直接交由經銷商收購，或者直接去農貿市場銷售，沒有計劃性，對市場變化反應慢。生產組織分散，經營規模小，組織化程度低，削弱了供應鏈組織的競爭優勢。

2、食用農產品供應鏈組織中缺乏真正有領導能力的核心企業。在現實的管理實踐中，食用農產品供應鏈的核心企業多是加工生產企業或銷售企業，然而這些企業受自身規模的影響，或過多地考慮自己的利益，在供應鏈中所起的領導作用不明顯，這削弱了食用農產品供應鏈作為戰略聯盟的整體競爭優勢。社會化資源整合能力的不足等使得供應鏈管理中參與各方處于斷裂或較少關聯的自流狀態下，形不成供應鏈的一體化組織協同運作。

3、市場競爭的無序導致供應鏈人為割裂，供應鏈一體化程度低。首先，食用農產品市場法律法規建設的薄弱和區域性壁壘導致市場分布的人為割裂;其次農產品交易的市場體系、交易方式、服務手段建設的落后，很難使全國農產品供應鏈形成統一高效的一體化網絡。

4、農產品供應鏈流通基礎設施建設落后，缺乏統一的食用農產品供應鏈質量安全管理信息平臺;冷鏈物流建設落后;食用農產品供應鏈質量監管體系不健全，等等。

5、不重視供應鏈管理中極為關鍵的信息化平臺的搭建，造成信息不對稱，從而引起經營成本、管理成本、決策成本、采購成本、運輸成本、包裝成本、生產加工成本、市場成本無形中被加大和農產品市場價格波動比較大。